GCLUST_VARIABLES version 3.5.5k
2200	: largeprotein
35000	: max_n3
10000	: max_matrix
0.925000	: level1
1.350000	: level2
0.200000	: level3
0.500000	: level4
0.200000	: matchlevel
0.100000	: minlevel
0.450000	: min_filled
0.350000	: min_filled2
10	: min_zeros
0.800000	: min_0_occup
18	: number_of_genomes
1000	: suppress_large_matrix
20000	: stack_size
50	: min_domain_size
0.400000	: searchbridge_min_triangle (save mode)
14	: searchbridge_min_n4	if zero, identical to number of genomes (save mode)
0.500000	: levelF1, parameters in OptimizeOrg
0.900000	: levelF2
0.300000	: levelF3
4	: min_overlap
5	: delta_diff
0	: delta_plus
5.600000	: org_measure_0
0.300000	: org_measure_1
0.600000	: allowance_level_0
0.025000	: allowance_level_1
0.070000	: JS_level_0
0.010000	: JS_level_1
0.950000	: MDR_level_0
0.030000	: MDR_level_1
1.000000	: MDR_max_cluster_0
0.100000	: MDR_max_cluster_1
70	: MDR_length1
120	: MDR_length2
1.000000e-30	: MDR_score1
1.000000e-45	: MDR_score2
0.900000	: CC_level_2 (CreateCliques)
0.200000	: CC_level_3 (CreateCliques)
1.000000e-40	: CC_min_thr (CreateCliques)
14	: num_thr
  1.00e-99	: thr level 0
  1.00e-80	: thr level 1
  1.00e-70	: thr level 2
  1.00e-60	: thr level 3
  1.00e-50	: thr level 4
  1.00e-40	: thr level 5
  1.00e-35	: thr level 6
  1.00e-30	: thr level 7
  1.00e-25	: thr level 8
  1.00e-20	: thr level 9
  1.00e-15	: thr level 10
  1.00e-11	: thr level 11
  1.00e-08	: thr level 12
  1.00e-06	: thr level 13
END
